國道3號中寮隧道北口路段穿越旗山及車瓜林2個活動斷層帶，因斷層活動造成隧道內路面隆起及高架橋端擠壓伸縮縫損壞，為解決此危害，高公局於109年4月完成拆除橋隧、改建路堤之改善工程，採與斷層和平共處方式，以柔性結構(路堤、路塹)取代剛性結構(橋梁、隧道)，有效吸納大地與斷層活動抬升擠壓等變形，同時也設置監測儀器辦理大地變位監測。
高公局為確保各項設施完善及用路人行車安全，除依養護手冊等規定辦理巡查及維護工作外，特別增加每2個月定期測量路面高程，以確認路面維持平順，並持續監測以觀察斷層帶對本路段的影響，期間歷經多次地震(如111年9月18日臺東關山大地震、113年4月3日花蓮大地震，以及今年1月21日嘉義大埔地震)，監測結果顯示本路段之隧道及邊坡等設施均安全無虞；至於路面部分，因受斷層擠壓影響有穩定抬升之情形，高公局也定期辦理路面刨鋪工作，以保持行車品質及安全，用路人可以安心通行。
高公局進一步說明，考量中寮隧道路段大地變位作用仍持續以每年8公分速度抬升，109年辦理改善工程時已採增加級配及AC厚度方式預為因應，除每年須以路面刨鋪方式維持縱坡線形，第3年則辦理路面深層處理。另排水設施等結構因受斷層抬升影響亦有部分損壞，為避免滲水造成路面沉陷，高公局利用透地雷達及測量等方式掌握損壞狀況，並採深層灌漿方式進行改善，相關工程將與路面工程一併辦理。
高公局將於今(114)年辦理前開改善工程，工程標預計4月上網公告，工期約1年，施工期間除初期須全日封閉中寮隧道北口南、北雙向各1~2車道約10日略影響交通外，其餘階段將採夜間施工、白天恢復通行、假日不施工方式進行，減少施工期間對用路人之影響。
高公局表示，本工程施工前將預先辦理公告，在施工期間，為避免交通不便，建議用路人可使用高公局1968App或撥打1968路況查詢專線、收聽警察廣播電臺（FM93.1和FM104.9頻道），以及透過高公局全球資訊網（https://www.freeway.gov.tw/）瞭解即時路況資訊，提前規劃行車路線。施工區域內的用路人，請減速慢行，依照指示牌與施工單位設置的導引標誌行駛，並遵循現場管制人員的引導，共同確保行車安全。