本部職員及約聘僱人員如遭受職場霸凌侵害，可向本部人事處申訴；技工、工友、駕駛及駐衛警如遭受職場霸凌侵害，可向本部秘書處申訴；本部所屬機關(構)同仁如有遭受疑似職場霸凌侵害，請向服務機關(構)人事或職安單位申訴。

本部人事處申訴管道如下：
1. 申訴專線電話：02-2349-2530
2. 申訴傳真：02-2388-5116
3. 申訴電子信箱：heart@motc.gov.tw

本部秘書處申訴管道如下：
1. 申訴專線電話：02-2349-2468
2. 申訴傳真：02-2382-6686
3. 申訴電子信箱：aken@motc.gov.tw

本部收受案件後，將由專人處理並對案情及相關調查程序嚴守保密義務。本部同仁如不確定是否遭到職場霸凌對待，也可先尋求本部委外專業諮詢顧問的協助【免費諮詢專線：0800-800-590，本委外諮詢服務僅供本部同仁使用】。